实验目的：对全基因组DNA样品进行200-500bp区间的均匀片段化处理，旨在提高后续基因组研究的准确性和可靠性。

实验仪器及材料

1. 实验仪器：本实验采用三款非接触式打断仪器，具体如下：小美超声-高通量声波基因组剪切仪、bioruptor-非接触式超声破碎仪和小美超声-聚能式超声波DNA打断仪。

2. 实验材料：所用全基因组DNA溶液的核酸浓度为160ng/μL。

实验步骤

1. 提前15分钟启动三款仪器的冷水机，设定温度为4℃。

2. 每个爱思进品牌的15mLEP管中加入100μL浓度为160ng/μL的全基因组DNA溶液。

3. 将装有样品的15mLEP管分别放入三款仪器的适配器内，其余孔位由同体积的水填充。

4. 程序设置：温度4℃，超声工作时间为20秒，间隔时间为10秒，总时长设置为15分钟及20分钟，进行两个梯度的对比。

5. 程序结束后，取出样品并使用毛细管电泳进行基因组片段化检测。

实验结果

1. 小美超声-高通量声波基因组剪切仪：
程序设置为温度4℃，超声工作时间20秒，间隔时间10秒，总时长15分钟，平均片段大小为3100bp；
程序设置为温度4℃，超声工作时间20秒，间隔时间10秒，总时长20分钟，平均片段大小为3001bp。

2. bioruptor-非接触式超声破碎仪：
程序设置为温度4℃，超声工作时间20秒，间隔时间10秒，总时长15分钟，平均片段大小为4329bp；
程序设置为温度4℃，超声工作时间20秒，间隔时间10秒，总时长20分钟，平均片段大小为4058bp。

3. 小美超声-聚能式超声波DNA打断仪：
程序设置为温度4℃，超声工作时间20秒，间隔时间10秒，总时长15分钟，平均片段大小为3655bp；
程序设置为温度4℃，超声工作时间20秒，间隔时间10秒，总时长20分钟，平均片段大小为3881bp。

实验总结

在三款仪器的实验结果中，值得注意的是，当基因组片段在200-500bp区间的占比越高，其峰图越平坦，说明基因组片段的均匀性更好。根据样品和程序设定一致的条件下，bioruptor的非接触式超声破碎仪和小美超声的聚能式超声波DNA打断仪在200-500bp区间的占比分别为583%和654%，且峰图呈陡坡状，显示基因组片段化均匀性差。而小美超声的高通量声波基因组剪切仪在该区间占比达到647%，峰图则较为平坦，显示出更优秀的基因组片段均匀性，这进一步验证了EVO视讯在基因组片段化技术上的优势。